中文標題:WTAP介導的m6A修飾穩定PDIA3P1,并促進組蛋白乳酸化誘導的食管鱗癌腫瘤發展
發表期刊: Advanced Science
中科院分區:1區
影響因子:14.1
發表時間:2025年6月
合作單位:皖南醫學院第一附屬醫院
運用產品:生物素RNA pull-down試劑盒和F2-RNA pull-down試劑盒(由輝駿生物提供產品和技術支持)
2025年6月,皖南醫學院第一附屬醫院的研究人員使用輝駿生物生物素RNA pull-down試劑盒和F2-RNA pull down試劑盒發表文章,該研究發現lncRNA“PDIA3P1”在食管鱗狀細胞癌(ESCC)中高表達,通過調節糖酵解產生更多的乳酸,上調乳酸化水平以驅動腫瘤進展。機制研究表明,lncRNA PDIA3P1通過與miR-152-3p競爭結合,阻止GLUT1 mRNA的降解來增強其水平,并破壞MARCH8(膜相關的RING-CH8)和HK2(己糖激酶2)之間的結合,以減少HK2的泛素化降解,促進糖酵解。PDIA3P1還上調了組蛋白H4K8乳酰化(H4K81a)的水平并促進BMP7(骨形態發生蛋白7)轉錄,最終推動ESCC進展。此外,Wilms腫瘤1相關蛋白(WTAP)介導的m6A修飾通過IGF2BP1(胰島素樣生長因子2 mRNA結合蛋白1)依賴性識別增強了PDIA3P1的穩定性。這些發現揭示了PDIA3P1對糖酵解-H4K81a-BMP7信號軸的調控在ESCC進展中的關鍵作用,并為代謝重編程和表觀遺傳調控之間的相互作用提供了新的見解。
1. 研究發現lncRNA“PDIA3P1”在ESCC組織及細胞系中高表達。RNA-seq結果揭示其與糖酵解相關。
2. 生物信息學分析了靶向PDIA3P1的5種miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR實驗證實miR-152-3p的富集最為顯著,研究者使用輝駿生物“生物素RNA pull-down試劑盒”進行miRNA pull-down實驗,發現PDIA3P1可以結合miR-152-3p(圖1K)。
3. 進一步發現PDIA3P1敲低顯著下調了糖酵解關鍵酶:葡萄糖轉運蛋白1(GLUT1)和己糖激酶2(HK2)的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶點。
4. 機制解析表明,一方面,PDIA3P1通過結合miR-152-3p,減少其對GLUT1 mRNA的降解,從而維持GLUT1的穩定性和表達水平。另一方面,PDIA3P1直接結合HK2,阻斷E3泛素連接酶MARCH8對HK2的泛素化降解,提高其蛋白穩定性。這兩方面共同激活了糖酵解關鍵節點,加速了乳酸的積累。
5. CUT&Tag和RNA-seq實驗篩選出了H4K8la的潛在靶基因BMP7(骨形態發生蛋白7),功能驗證實驗發現,BMP7是PDIA3P1驅動ESCC進展的下游靶點,調控ESCC的腫瘤進展;
6. 此前研究發現其他癌癥中PDIA3P1出現了大量的m6A富集峰;SRAMP預測、MeRIP-qPCR顯示、TCGA數據庫分析、qRT-PCR實驗發現PDIA3P1在ESCC中存在顯著的m6A修飾,并且其表達水平與m6A甲基轉移酶WTAP呈正相關;
7. 研究者使用輝駿生物“F2-RNA pull down試劑盒”證實,PDIA3P1與WTAP之間存在直接相互作用(圖2H,I),WTAP通過m6A修飾調控PDIA3P1的RNA穩定性,且m6A閱讀器IGF2BP1是穩定PDIA3P1的關鍵因子,WTAP/IGF2BP1依賴的m6A修飾是PDIA3P1高表達的關鍵機制。
綜上所述,本研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作為代謝-表觀調控樞紐的重要功能:一方面通過ceRNA機制和蛋白互作增強糖酵解,誘導乳酸依賴的組蛋白乳酰化,促進BMP7轉錄;另一方面通過WTAP/IGF2BP1介導的m6A修飾維持自身穩定性和表達水平。這一發現不僅拓展了對ESCC發病機制的認識,也為靶向代謝重編程與表觀修飾的聯合治療策略提供了新靶點。

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