免疫共沉淀(Co-IP)* 實驗原理
結合了抗體的磁珠或樹脂(Beads)與樣本裂解液孵育,通過”抗原-抗體“之間的免疫作用,誘餌蛋白被吸附在Beads上,與此同時,誘餌蛋白的互作蛋白,也一起“共沉淀”到Beads上。洗滌去掉未結合的蛋白后,再用洗脫緩沖液將互作蛋白復合物從Beads上洗脫下來,得到免疫共沉淀(Co-IP)產物。Co-IP產物既可以用Western Blot檢測已知蛋白,也可以用質譜鑒定未知蛋白。
當沒有合適的誘餌蛋白抗體時,還可以通過表達融合了Flag標簽的誘餌蛋白,利用Flag標簽抗體做免疫沉淀。即樣本過表達Flag-Bait,經裂解后與anti-Flag珠子孵育,誘餌融合蛋白與Beads結合,其互作蛋白“共沉淀”到Beads上,再經洗滌、洗脫后,用WB或質譜檢測。
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免疫共沉淀(Co-IP)* 實驗流程

內源蛋白抗體免疫共沉淀CoIP實驗步驟

標簽抗體免疫共沉淀CoIP實驗流程
免疫共沉淀(Co-IP)* 應用背景
蛋白質之間相互作用是其發揮生物學功能的主要模式,蛋白質會通過結合不同的伙伴來行駛不同的功能,形成復雜的信號轉導網絡。常見的蛋白互作研究方法主要有:免疫共沉淀(Co-IP)、pull down、酵母雙雜交、熒光雙分子互補(BiFC)、熒光共定位等。這些方法相互補充,通過多種方法共同驗證蛋白質間的相互作用,能更大程度的避免假陽性結果。
Co-IP技術采用抗體捕獲樣本中的目標蛋白及其互作蛋白復合物,反應的是體內真實的生理結合,但不能顯示這些相互作用是直接還是間接的;另外合適的免疫共沉淀抗體是決定實驗成功的關鍵,有些蛋白沒有合適的IP抗體,無法進行內源性Co-IP實驗;通過構建帶標簽的表達載體,使目標蛋白與標簽融合表達,再借助標簽抗體即可完成Co-IP實驗,但需要注意合適的轉基因方法又是影響該方法成功的關鍵。
pull down技術將目標蛋白進行體外原核表達,使標簽蛋白(GST或His等)與目標蛋白融合表達,借助標簽的親和介質將目標蛋白純化出來,可以不受抗體、物種限制,比較輕松的獲得目標蛋白的結合蛋白,還可以通過外源同時表達目標蛋白和待測蛋白,確定它們是否發生直接的相互作用,但該方法無法得知體內真實的結合情況。
酵母雙雜交技術是比較古老的一種技術,將目標蛋白和待測蛋白與GAL4
的兩個結構域BD和AD融合表達,在酵母細胞中,2個蛋白的結合使得BD和AD在空間上靠近,從而激活報告基因lacZ的表達。但是由于受試蛋白都需要和
AD/BD 結構域形成融合蛋白,空間構象可能改變;另外假陽性率也比較高。
熒光雙分子互補(BiFC)技術將目標蛋白和待測蛋白分別與GFP的兩個片段融合表達,轉染細胞后,2個蛋白的結合使得GFP兩個片段空間上靠近,從而發出綠色熒光,該技術觀測直觀,操作簡便,但空間分辨率大約
250nm,對于蛋白質相互作用來說依然是個相當遠的距離,因此位置上靠近但并未結合的蛋白也可能顯示陽性結果,假陽性率較高;另外該技術可以驗證蛋白間的相互作用,但不能篩選未知互作蛋白。
熒光共定位技術依靠熒光確定蛋白質具有相同定位,用于輔助證明而非直接證明細胞內蛋白間的相互作用。
免疫共沉淀Co-IP * 輝駿服務內容
服務項目
| 服務內容 | 結果交付 | 實驗周期 | 客戶提供
| 價格
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Co-IP WB (驗證型) | 樣本質檢 (Western blot檢測誘餌蛋白和待測蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 樣本的待測蛋白Western blot檢測圖 | 3-4周 | 實驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 待測蛋白抗體 實驗信息表 |
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Co-IP調取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | IP產物的誘餌蛋白Western blot檢測圖
IP產物的待測蛋白Western blot檢測圖 CoIP實驗報告 |
Co-IP MS (篩選型) | 樣本質檢(Western blot檢測誘餌蛋白) | 樣本的誘餌蛋白Western blot檢測圖 | 5-6周 | 實驗樣本 誘餌蛋白的IP級抗體 實驗信息表 |
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Co-IP調取誘餌蛋白及其互作蛋白 (2組:實驗組、對照組) | IP產物的誘餌蛋白Western blot檢測圖
CoIP實驗服務報告 |
| IP產物的質譜檢測及數據分析 | 質譜(LC-MS/MS)檢測結果及報告 互作蛋白篩選表格 生物信息學分析結果和報告 |
免疫共沉淀CoIP * 樣本要求
樣本類型
| COIP-WB 建議送樣量 | COIP-MS 建議送樣量 |
| 動物細胞 | 3*10e7個細胞/組(約3個10cm皿) | 5*10e7個細胞/組(約5個10cm皿) |
| 動物組織 | 1g/組 | 2g/組 |
| 植物葉片 | 2g/組 | 4g/組 |
| 植物根或果實 | 4g/組
| 8g/組 |
| 菌體 | 50ul菌體沉淀/組 | 100ul菌體沉淀/組 |
▲注意:這里列出的均為每組樣本的送樣量,如果實驗和對照組用的樣本一致,此樣本量*2。詳細送樣指南可聯系輝駿生物客服或銷售索取。
保存及運輸:-80℃保存,干冰取樣/運輸,至少在送樣前2天通知我司。
免疫共沉淀Co-IP * 結果示例

Co-IP WB:誘餌蛋白和待測蛋白Western blot檢測圖(陽性)

Co-IP MS:誘餌蛋白Western blot檢測圖

Co-IP MS:質譜檢索表格(部分展示)

Co-IP MS:互作蛋白生信分析結果(部分展示)
免疫共沉淀(Co-IP)服務案例—客戶文章解析
Jiang S.Y. et al: Cholesterol Induces Epithelial-to-Mesenchymal Transition of Prostate Cancer Cells by Suppressing Degradation of EGFR through APMAP. Cancer Research. 2019. (中科院1區,IF=13.312).
膽固醇通過APMAP抑制EGFR降解誘導前列腺癌細胞轉移
研究概述
轉移性前列腺癌具有很高的致命性。已有報道表明,膽固醇與前列腺癌的發展有關;前期研究發現,膽固醇可以誘導前列腺癌細胞發生上皮-間質轉化(EMT),但其作用及潛在機制尚不清楚。本研究證明膽固醇介導APMAP上調,APMAP通過與EGFR競爭結合EPS15R,進而抑制EGFR降解,激活ERK1/2通路,促進前列腺癌細胞EMT;提出APMAP可能是一種關鍵的調節劑,為高脂肪飲食、肥胖和癌癥轉移之間提供了聯系。

研究路線
細胞功能實驗證實膽醇誘導前列腺癌細胞EMT的發生依賴于ERK1/2的激活RNA-seq、蛋白組學等實驗篩選和驗證與膽固醇有關的差異基因和蛋白,確定ERK1/2的上游凋節因子“ APMAI和“"EGFR”作為后續研究目標APMAP基因敵除后的RNA-seq結果及其細胞實驗均顯示APMAP和膽固醇可能有相似的功能APMAP和EGFR的表達關系實驗表明 APMAP通過調節EGFR參與膽固醇誘導的EMT過程免疫共沉淀Co-IP結合質譜實驗找到 APMAP的互作蛋白EPS15R免疫熒光結果顯示膽固醇誘導使EPS15R和APMAP的作用增強,EPS15R與EGFR解離,進而抑制EGFR降解
免疫共沉淀(Co-IP) * 客戶文章