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「輝駿客戶文章」Adv Sci ( IF=14.1 )|RNA pull down試劑盒助力WTAP介導的m6A修飾促食管鱗癌機制研究
發布時間:2025-08-07 14:32:37作者:輝駿生物-fitgene

2025年6月5日,皖南醫學院第一附屬醫院朱少金教授南京醫科大學附屬無錫人民醫院毛文君教授團隊共同合作,在Advanced ScienceIF=14.1)發表了題為“WTAP Mediated m6A Modification Stabilizes PDIA3P1 and Promotes Tumor Progression Driven by Histone Lactylation in Esophageal Squamous Cell Carcinoma”的研究論文


非常榮幸,輝駿生物產品生物素RNA pull down試劑盒(貨號:FI8702)F2-RNA pull down試劑盒(貨號:FI8701),助該研究一臂之力。


輝駿生物RNA pulldown試劑盒客戶文獻.png
01

究摘要


食管鱗狀細胞癌(ESCC)是一種常見的消化道惡性腫瘤,發病率高,死亡率高。許多研究表明,長鏈非編碼RNAlncRNAs參與了各種類型腫瘤的發展。lncRNA PDIA3P1促進ESCC的進展,但其背后的分子機制尚不清楚。


作者研究發現,lncRNA PDIA3P1在ESCC中高度表達。它可作為miRNA海綿吸附"miR-152-3p",進而降低GLUT1(葡萄糖轉運體1)的 mRNA水平;它還通過結合下游靶點HK2(己糖激酶2)來阻礙其泛素化降解,促進糖酵解。高度活躍的糖酵解產生更多乳酸,進而上調組蛋白H4K8乳酸化(H4K8la)水平,促進BMP7(靶基因骨形態發生蛋白7)的轉錄,從而推動腫瘤進展。此外,WTAP介導的m6A修飾通過IGF2BP1依賴性識別來增強PDIA3P1的穩定性。


02

究思路

研究發現lncRNA“PDIA3P1”在ESCC組織及細胞系中高表達RNA-seq結果揭示其與糖酵解相關。


生物信息學分析了靶向PDIA3P1的5種miRNA,AGO2蛋白的RIP-qPCR實驗證實miR-152-3p的富集最為顯著,研究者使用輝駿生物“生物素RNA pull down試劑盒”進行miRNA pull down實驗,發現PDIA3P1可以結合miR-152-3p(圖1K)。

圖1.jpg

1 PDIA3P1作為miR-152-3p的海綿調節GLUT1的表達


PDIA3P1敲低顯著下調了糖酵解關鍵酶:GLUT1和HK2的蛋白水平,且二者是PDIA3P1的下游靶點。


機制解析發現,一方面,PDIA3P1通過競爭結合miR-152-3p,減少其對GLUT1 mRNA的降解,從而維持GLUT1的穩定性和表達水平,另一方面,PDIA3P1直接結合HK2,阻斷E3泛素連接酶MARCH8對HK2的泛素化降解,提高其蛋白穩定性。這兩方面共同激活了糖酵解關鍵節點,加速了乳酸的積累。


CUT&Tag和RNA-seq實驗篩選出了H4K8la的潛在靶基因BMP7(骨形態發生蛋白7),功能驗證實驗發現,BMP7是PDIA3P1驅動ESCC進展的下游靶點,調控ESCC的腫瘤進展。


此前研究發現其他癌癥中PDIA3P1出現了大量的m6A富集峰;SRAMP預測MeRIP-qPCR顯示TCGA數據庫分析、qRT-PCR實驗發現PDIA3P1在ESCC中存在顯著的m6A修飾,并且其表達水平與m6A甲基轉移酶WTAP呈正相關。


研究者使用輝駿生物“F2-RNA pull down試劑盒”證實,PDIA3P1與WTAP之間存在直接相互作用(圖2H,I),WTAP通過m6A修飾調控PDIA3P1的RNA穩定性,且m6A閱讀器IGF2BP1是穩定PDIA3P1的關鍵因子,WTAP/IGF2BP1依賴的m6A修飾是PDIA3P1高表達的關鍵機制。

PDIA3P1穩定性增強源于IGF2BP1對WTAP介導的m6A修飾的識別

圖2 PDIA3P1穩定性增強源于IGF2BP1對WTAP介導的m6A修飾的識別


綜上所述,研究揭示了PDIA3P1在ESCC中作為代謝-表觀調控樞紐的重要功能:一方面通過ceRNA機制和蛋白互作增強糖酵解,誘導乳酸依賴的組蛋白乳酰化,促進BMP7轉錄;另一方面通過WTAP/IGF2BP1介導的m6A修飾維持自身穩定性和表達水平。這一發現不僅拓展了對ESCC發病機制的認識,也為靶向代謝重編程與表觀修飾的聯合治療策略提供了新靶點。


  使用產品:
生物素RNA pull downF2-RNA pull down試劑盒(由輝駿生物提供產品和技術支持)


03

產品介紹

產品信息

貨號

產品名稱

FI8701

F2-RNA pull down Kit專利產品

FI8702

Biotin-Labeled RNA pull down Kit


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實驗服務


服務項目

服務內容

F2-RNA pull down

制備RNA正義鏈和反義鏈探針、Western blot檢測樣本中的待測蛋白、RNA pull down捕獲目標RNA及其結合蛋白

miRNA pull down qPCR

合成生物素miRNA探針、qPCR檢測樣本中的待測靶RNA、miRNA pull down捕獲miRNA-靶RNA復合體并檢測(實驗組、對照組)


04

服務優勢

01

十年服務經驗,客戶成果發表在Nature Methods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。

02

對圍繞RNA結合蛋白開展的整體課題提供全方位指導,包括上下游實驗設計和結合蛋白的多方法驗證等。

03

自有蛋白質組學平臺,對RNA pull down產物這類微量蛋白的質譜鑒定有十足的把控能力,對后續的生物信息分析有獨到的見解。

04

售后技術支持將一直保持到客戶發表文章,確保客戶安心進行下游實驗及投稿。



輝駿生物,10年專注分子互作和蛋白研究,專業提供蛋白、核酸互作產品和技術服務。輝駿自有蛋白質檢測平臺,擅長互作產物等微量蛋白的質譜鑒定及生物信息分


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